Ancestry.com 利用客户的 DNA 重建 19 世纪夫妇的基因组

Ancestry.com 利用客户的 DNA 重建 19 世纪夫妇的基因组

19 世纪,大卫·斯皮格尔是阿拉巴马州的一名传教士。他显然非常重视《圣经》中“生养众多”的教诲。他有 26 个孩子和 150 多个孙辈。从那时起,他的后代数量不断增加。如今,美国有如此多的斯皮格尔后代,以至于一个流行的家族史网站 Ancestry.com 仅使用来自其客户的数据就能重建斯皮格尔及其配偶的大部分基因组。

Ancestry.com 的遗传学家已经重建了足够多的 Speegle 及其两位妻子的 DNA,他们已经找到了一个人身上预期的 50% 的基因,该公司今天宣布。重建项目让我们得以一窥 200 年前人们的生物学,而且完全没有从 Speegle 及其妻子身上取下头发或其他部分。太酷了。该项目还展示了 Ancestry.com 所拥有的家谱和 DNA 样本的集体力量。

Ancestry.com 基因组学副总裁凯瑟琳·鲍尔 (Catherine Ball) 告诉《大众科学》杂志:“我们的数据库中有超过 50 万个基因型样本,其中许多(如果不是大多数的话)样本都与许多人花费数年时间构建的庞大家谱有关。” Ancestry.com 用户在使用该网站时上传的这些数据对重建项目至关重要。

“这可能是相对准确的,因为他们拥有如此惊人的数据库。”

“这可能是相对准确的,因为他们有如此惊人的数据库,”纽约州立大学石溪分校的人口遗传学家 Brenna Henn(未在该网站工作)说。“这对客户来说当然很酷。”

Ancestry.com 的用户首先会填写他们所知道的家谱部分,例如父母或祖父母的姓名和出生日期。然后,该网站的算法会使用自己的出生证明、移民表格和其他官方记录数据库,帮助客户填写家谱中以前不为人知的成员。用户只需支付 100 美元,即可将唾液样本送至 Ancestry.com 进行 DNA 测序。Ancestry.com 会利用 DNA 告诉用户他们的种族起源,并进一步填写用户的家谱。

为了重建斯皮格尔和他妻子的基因组,Ancestry.com 的遗传学家利用该网站的家谱寻找那些送来唾液并且最后共同祖先是斯皮格尔的客户。只要这些客户的 DNA 片段彼此相同,遗传学家就知道这些片段一定来自斯皮格尔和他的其中一位妻子——要么是他的第一任妻子温妮弗雷德,要么是他在温妮弗雷德死后娶的南希。遗传学家还查看了整个斯皮格尔家谱,寻找整个家谱中的共同基因。

该公司公关官梅丽莎·加勒特 (Melissa Garrett) 表示,该公司今天将该项目告知了斯皮格尔的后代,他们是 Ancestry.com 的客户。然而,Ancestry.com 并不打算为其他用户重复同样的项目。“我们打算尝试重建,这实际上是为了验证概念,”鲍尔说。既然公司知道他们可以做到这一点,他们就不会再这样做了,除非他们想测试新的 DNA 重建技术。

“如果你有六个甚至六个孩子,那么你的大部分基因组现在仍然存在。”

Ancestry.com 的遗传学家之所以选择 Speegle 家族进行重建,是因为这个家族特别庞大,能为他们提供大量数据。但从他们在客户中看到的情况来看,他们认为 Speegle 时代的大多数美国家族如今都有很多后代。

“18 世纪和 19 世纪的美国人可能确实生了足够多的孩子,以至于他们的大部分基因组现在仍在传播,”鲍尔说。“如果你有六七个孩子,你的大部分基因组现在仍会传播。”

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