纽约植物园数字化生物多样性历史

纽约植物园数字化生物多样性历史

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外面有大量的生物多样性信息,但其中大部分都被锁在自然历史收藏中。为了让所有这些植物数据更容易获取,纽约植物园——世界上四大植物标本馆之一——正在将其 730 多万个标本转化为可浏览的数字数据库。

纽约植物园植物标本馆于 1900 年左右开放,从第一天起,收藏家和其他私人植物标本馆就已收集了超过 10 万件标本。每年都有新的藏品陆续入驻,馆长们也到世界各地收集标本。植物标本馆五层楼的每一层都有一间恒温房间,钢柜内摆放着一些标本,它们可以让我们了解植物的过去。值得注意的是,这些藏品中甚至包括乔治·华盛顿·卡弗收集的真菌和查尔斯·达尔文的苔藓标本。

该收藏品包括查尔斯·达尔文的苔藓标本。

数字化项目始于 20 世纪 90 年代中期,从那时起,该技术不断改进,因此速度大大加快。一开始,大型工作室设置了大灯和相机,帮助捕捉标本图像。现在,纽约植物园使用最初为拍摄珠宝而设计的灯箱。灯箱具有均匀、标准化的照明,并将图像数据直接输入计算机。当该团队 10 多年前开始这个项目时,他们每年要数字化大约 20,000 到 30,000 个标本。随着技术的升级和人力的增加,他们每年可以捕捉超过 100,000 个标本。今年秋天,该团队数字化了他们的第 200 万个标本。

纽约植物园数字化信息经理金伯利·沃森 (Kimberly Watson) 告诉《大众科学》 :“在过去一年半左右的时间里,我们都会安排一个人坐在电脑前,手动从标签上获取标本数据。现在,我们可以拍照,并通过光学字符识别软件处理数据。”

纽约植物园的许多标本都是压制植物,它们被粘在标准尺寸的纸张上并储存在档案条件下。除了维管植物外,还有真菌、藻类和地衣等灵丹妙药。虽然植物园可能会收到将某些标本数字化的请求——植物园会尊重这一请求——但团队倾向于将标本数字化作为项目。

“我们现在根据需求进行大量成像,”纽约植物园威廉和林达·斯蒂尔植物标本馆馆长芭芭拉·蒂尔斯 (Barbara Thiers) 表示。“我们每周都会收到一份在线数据请求。我们收到了很多关于该项目的反馈,尽管一段时间后人们不会定期告诉你。但我们知道它正在被使用。”

美国国家科学基金会多年来一直为自然科学藏品的数字化工作提供资金,尤其是纽约植物园,自 1997 年以来一直获得持续资助。美国国家科学基金会已让许多机构围绕特定的数字化项目展开合作,并举办研讨会分享最佳实践。

虽然数字植物标本馆对于需要实物样本或标本 DNA 的研究人员来说可能还不够,但在线数据库可以通过新的方式进一步研究。

“事实证明,这些数据有很多我们开始时未必预想到的用途,”蒂尔斯说。由于标本数据包括采集时间和地点,研究人员可以开始使用这些数据来了解植物在过去 150 年中的变化,并将这些信息与其他数据集(如降雨、土壤化学、水文和其他对植物生长至关重要的因素)结合起来。

请查看画廊中 200 万个(并且还在不断增加!)数字化标本中的一小部分。

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